《神曲奏界 Polyphonica Crimson S》延续前作世界观，舞台设定在精灵与人类共存的音乐大陆POLYPHONICA。在这里，神曲乐士通过演奏“神曲”支配精灵之力，而精灵则以此获得实体与共鸣。少年塔塔拉·弗洛恩是少数能同时契约多只精灵的罕见乐士，他与高等精灵珂琦·琳·梅尔组成搭档，本过着平静的学院生活。然而，一封来自神曲协会的紧急委托打破了日常——大陆各地接连出现精灵暴走事件，其背后疑似与古代禁忌的“黑色乐谱”有关。为了追查真相，塔塔拉与珂琦踏上旅途，途中遭遇神秘组织“S”的阻挠，也结识了背负沉痛过去的同伴。随着调查深入，他们发现暴走的根源竟与珂琦的诞生秘密紧密相连。当旋律化为力量，当绯红的契约之光燃亮暗夜，这对搭档必须用神曲回应世界的哀鸣。本作在延续宏大设定的同时，更聚焦于信任与羁绊，用音符与热血谱写出新的乐章。